产品货号:
BTN131036
中文名称:
DNA 5'末端磷酸化试剂盒
英文名称:
DNA 5' End Phosphorylation Kit
产品规格:
20次
发货周期:
1~3天
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本制品为DNA 5'末端标记系统,利用T4 Polynucleotide Kinase(T4多聚核苷酸激酶)和[γ-32P]ATP对粘性末端或平末端的DNA或RNA的5'末端进行高效标记反应.
- 使用本试剂盒之前,不需要对5'末端的磷酸基团进行去磷酸化处理,因为使用的kinase能使5'末端的磷酸与[γ-32P]ATP的γ-磷酸进行交换。
- 合成的单链或双寡核苷酸的5'末端游离的OH基团都能通过Kinase反应被标记(或者只是简单的磷酸化)。
- 提供的两种反应液使交换反应和磷酸化反应都能高效进行,均能得到大于106cpm/pmol(5'﹣end)的比活性。
- 快速,最快25分钟即可完成标记反应。
- 本制品足够20次20μL体系的填入法标记实验。
- 本制品只能用于科研。
组分 | 规格 |
T4多聚核苷酸激酶(10U/μL) | 20μL |
5×交换反应缓冲液 | 100μL |
10×磷酸缓冲液 | 50μL |
Control DNA | 20μL |
保存:-20℃,有效期1年。
DNA片段、[γ-32P]ATP或其它的标记、未标记的ATPs、牛小肠碱性磷酸。
一、交换反应
- 实验前需自备的试剂:7M醋酸铵、100%乙醇、70%乙醇等
- 在微量离心管中制备下列反应液:
注:5 pmoles的5'末端约等于0.17μg的长100bp的双链DNA。成分 用量 自备的5'磷酸化DNA片段 14μL(≤5pmoles的5′末端) 5×交换反应缓冲液 5μL [γ -32P] ATP 5μL T4多聚核苷酸激酶(10U/μL) 1μL 灭菌的超纯水 至25μL - 37℃反应30分钟。
- 70℃加热5~10分钟使酶失活。
- 加入10μL的7M CH3COONH4(pH4.5)。如使用CH3COONa做乙醇沉淀时使其终浓度达300mM。
- 加入87.5μL(2.5倍)的冷无水乙醇,-20℃放置30~60分钟。
- 离心回收沉淀,用70%的冷乙醇清洗沉淀,真空干燥。
- 用适当Buffer溶解沉淀。
注:通过第5~8步操作几乎可以除去大部分未反应的[γ-32P] ATP,如要完全其除去时,乙醇沉淀后用凝胶过滤等方法精制即可。如需用苯酚抽提除去蛋白质时,请在第8步之后进行。
二、磷酸化反应标记
- 去磷酸化反应
- 实验前需自备的试剂:TE饱和酚/氯仿、3M NaCl、100%乙醇、70%乙醇、牛小肠碱性磷酸酶(CIAP)等。
- 在微量离心管中制备下列反应液:
成分 用量 自备的DNA片段 133μL(≤10μg) 1M Tris-HCl,pH8.0 15μL 牛小肠碱性磷酸酶(CIAP,10~20U/μL) 2μL 灭菌的超纯水 至150μL - 50℃反应30分钟。
- 加入150μL的TE饱和酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),充分混匀。
- 离心,取上层(水层)移到另一个微量离心管中。
- 重复操作步骤12-13。
- 加入7.5μL的3M NaCl(最终浓度150mM)。
- 加入375μL(2.5倍量)的冷无水乙醇,-20℃放置30~60分钟。
- 离心回收沉淀,用1mL 70%的冷乙醇清洗后,沉淀真空干燥。
- 使用20μL的TE Buffer溶解沉淀。
- 实验前需自备的试剂:TE饱和酚/氯仿、3M NaCl、100%乙醇、70%乙醇、牛小肠碱性磷酸酶(CIAP)等。
- 磷酸化反应(前反应)
- 在微量离心管中制备下列反应液:
成分 用量 自备的DNA片段 133μL(≤10μg) 10×磷酸缓冲液 2.5μL [γ -32P] ATP 1μL T4多聚核苷酸激酶(10U/μL) 1μL 灭菌的超纯水 至25μL - 37℃反应30分钟。
- 下面的操作与交换反应的第4~8步操作相同。
- 在微量离心管中制备下列反应液:
三、合成DNA寡核苷酸的标记
- 在微量离心管中制备下列反应液:
成分 用量 Oligonucleotide DNA with free 5'-OH(5~10 pmoles) ≤3μL 10×磷酸缓冲液 2.5μL [γ -32P] ATP 1μL T4多聚核苷酸激酶(10U/μL) 1μL 灭菌的超纯水 至25μL - 37℃反应30分钟。
- 下面的操作与交换反应的第4~8步操作相同。
- 当掺入水平很低的时候,需要使用本步骤,即通过体积排阻色谱或过滤试剂盒除去未反应的标记。Sephadex G﹣50层析柱(需另购)对于去除未掺入的dNTPs效果很好,它还能大幅减少小于20个碱基的DNA寡核苷酸和小于20bp的双链DNA的量。使用之前需要在70℃加热5~10分钟以使T4多聚核苷酸激酶失活。Sephadex G-25层析柱可以用来纯化长度不小于10个碱基的寡核苷酸。
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